Mare: Pantelleria sorge in riva ad un mare verde-smeraldo o blu limpidissimo e incontaminato, dai fondali stupendi, vari per colori cromatici e profondità, fra i più intatti del bacino Mediterraneo, popolati da una fantastica fauna ittica. Speciali attrattive sono il Parco Marino e i siti archeologici subacquei dell'epoca punico-romana.
Località balneari dalla costa: Suvaki con la sua costa bassa e liscia; Sateria, nota per la grotta termale e seconda la leggenda mitologica alcova della Ninfa Calipso e di Ulisse; Scauri, l'antico approdo romano e attuale porto minore; Punta Fram dove si possono riconoscere le colate laviche pietrificate in forme insolite; Mursia; cala del Bue Marino; Karuscia; Campobello; Kattibuali; cala Cinque Denti; Laghetto delle Ondine; cala Tramontana; Cala Gadir; il Faraglione e cala Levante. L'Arco dell'Elefante merita una segnalazione speciale poiché è un incredibile monumento naturale di Pantelleria. Si prosegue con cala Rotonda; la Balata dei Turchi, dove si trova l'antichissima cava di ossidiana; il porticciolo di Nicà.
Porti: Pantelleria ha due porti essenziali come partenza di escursioni e giri dell'isola, il porto principale -distinguibile in PORTO VECCHIO e PORTO NUOVO "in paese", cioè a Pantelleria Centro, a nord dell'isola, dove attraccano quotidianemente le navi turistiche che collegano l'isola a Trapani; il PORTO DI SCAURI, rivolto verso le coste tunisine, da dove a volte avvengono i collegamenti turistici a seconda delle condizioni del mare e dei venti. Pantelleria ha altri approdi naturali e scali di pescatori quali il PORTICCIOLO DIETRO L'ISOLA che è una piccola insenatura, in prossimità di Punta Limarsi, utilizzato unicamente per ripararsi dal maestrale da cui è ridossato; il PORTICCIOLO DI CALA DI LEVANTE, un'insenatura naturale, ridossata da certi venti, dotata di un piccolo pontile dove è possibile attraccare con piccole unità. Vi si trova il relitto della nave Minerva, in ferro, semisommerso; il PORTICCIOLO DI CALA TRAMONTANA, una insenatura situata tra Punta Rubasacchi e Punta Tracino, che può offrire ridosso occasionale, dotata di uno scivolo per piccole imbarcazioni; il PORTICCIOLO DI CAMPOBELLO, ridossato da ponente e situato tra Punta Caruscia e Punta Spadillo.
Fauna e flora marina: sugli splendidi fondali isolani, misti a roccia, massi e sabbia, la fauna marina è molto ricca e comprende la Cernia, l'Aricciola, la Murena, il Dentice, il Sarago, l'Aragosta. Le acque isolane sono frequentate anche da gruppi di globicefali o balene pilota. Di recente ha fatto la sua ricomparsa uno dei mammiferi più rari al mondo, la foca monaca mentre frequenti sono gli entusiasmanti incontri con grossi trigoni, cetacei e delfini. Praterie di posidonie crescono rigogliose e i fondali corallini sono ricchi di tutti i tipi di gorgonie e del rarissimo corallo nero. Un'alga del bagnasciuga, presente solo a Pantelleria nell'Europa mediterranea è la cistofeira, mentre le alghe laminarie qui si sviluppano più che altrove. Tantissime sono le immersioni che si possono fare alla scoperta delle emozionanti bellezze offerte dai fondali di Pantelleria.
Coste: quasi esclusivamente scogliose, ricche di insenature, cale e promontori. Si tratta di scogli neri e frastagliati alternati a pietre lisce; scogliere basse e alture.
Lago di Venere: unica ampia spiaggia raggiungibile dalla terra.